DNA核酸濃度的測定實(shí)驗(yàn)應(yīng)用方案(超微量紫外分光法)
DNA核酸濃度的測定實(shí)驗(yàn)應(yīng)用方案(超微量紫外分光法)
引言寡核苷酸,單鏈、雙鏈DNA,以及RNA可以定量溶于緩沖液,構(gòu)成核酸的嘌呤堿和嘧啶堿具有共軛雙鍵,使核苷核和核酸在紫外線光具有特征性的吸收光譜,最大吸收峰為260nm。窄光帶紫外分光光度計(jì),長260nm.,比色杯光徑1cm,1個(gè)吸光度值(1A)相當(dāng)于50ug/ml雙螺DNA,40ug/ml單螺旋DNA或RNA),20 ug/ml寡核苷酸。
測試前,選擇正確的程序,輸入原液和稀釋液的體積,爾后測試空白液和樣品液。然而,實(shí)驗(yàn)并非一帆風(fēng)順。讀數(shù)不穩(wěn)定可能是實(shí)驗(yàn)者最頭痛的問題。靈敏度越高的儀器,表現(xiàn)出的吸光值漂移越大。
原理紫外分光光度法基于DNA鏈上堿基的苯環(huán)結(jié)構(gòu)在紫光區(qū)具有較強(qiáng)吸收,DNA/RNA在260nm處有最大的吸收峰,蛋白質(zhì)在28Onm處有最大的吸收峰,鹽和小分子則集中在230nm處。因此,可以用260nm波長進(jìn)行分光測定核酸濃度,OD值為1相當(dāng)于大約50ug/ml雙鏈 DNA,單鏈DNA濃度約為33ug l ml,RNA約為40ug/ml,寡核苷酸約為35ug/ml。如用1cm光徑,用 H,O稀釋DNA/RNA樣品n倍并以H,O為空白對(duì)照,根據(jù)此時(shí)讀出的OD260值即可計(jì)算出樣品稀釋前的濃度:
DNA (mg/ml ) =50×OD260 讀數(shù)×稀釋倍數(shù)/1000RNA (mg/ml) =40×OD260讀數(shù)×稀釋倍數(shù)/1000。
A280nm是蛋白和酚類物質(zhì)最高吸收峰的吸收波長,比值可進(jìn)行核酸樣品純度評(píng)估:純DNA的A260/A280比值為1.8,純RNA為2.0。假如比值低,表示受到蛋白(芳香族)
或分類物質(zhì)的污染,需要純化樣品。比值=1.5相當(dāng)于50%蛋白質(zhì)/DNA溶液。
A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波長,比值可進(jìn)行核酸樣品純度評(píng)估:純DNA和RNA的A260/A230比值為2.5。若比值小于2.0標(biāo)明樣品被碳水化合物(糖類)、鹽類或有機(jī)溶劑污染,需要純化樣品。
A320nm或A340nm為檢測溶液樣品的濁度,該值應(yīng)該接近0.0。假如不足,標(biāo)明溶液中有懸浮物,需要純化樣品。
儀器及試劑
比色杯
樣本DNA
雙蒸水
測定
1、將制備的DNA懸浮溶解于TE緩沖液中 pH8.0,10mmo1L的Tris緩沖液,內(nèi)含(1mmol/L EDTA)或懸浮溶解在滅菌水中(依據(jù)DNA含量加水)。
2、用可掃描的紫外分光光度計(jì)測定制備的DNA/RNA的紫外吸收曲線,測定OD260和OD280,并計(jì)算比值:OD260/OD280,純 DNA的此比值約為1.8~2.0。純RNA的此比值
約為大于2.0。
3、根據(jù)每毫升1微克的純DNA的OD260值=0.020,計(jì)算所得 DNA的純度:每毫升1微克的純RNA的OD260值=0.025,計(jì)算所得RNA的純度。
注意事項(xiàng)
OD值范圍應(yīng)該在0.1~0.99之間,否則不符合上述線性關(guān)系。
A260/A280比值可提供DNA純度的一個(gè)參考,但A260/A280比值會(huì)受pH影響。如果未調(diào)pH,比值可能與實(shí)際差別很大。如果需要準(zhǔn)確數(shù)值,建議在10 mM Tris Cl,pH 8.5中檢測,此時(shí)純凈的 DNA A260/A280比值應(yīng)為1.8-2.0(注意應(yīng)使用同樣緩沖液作為對(duì)照)
在測試時(shí),離子濃度太高,也會(huì)導(dǎo)致讀數(shù)漂移,因此建議使用pH值一定、離子濃度較低的緩沖液,如TE,可大大穩(wěn)定讀數(shù)。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由于樣品中不可避免存在一些細(xì)小的顆粒,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在干擾測試效果。為了最大程度減少顆粒對(duì)測試結(jié)果的影響,要求核酸吸光值至少大于0.1A,吸光值最好在0.1-1.5A。在此范圍內(nèi),顆粒的干擾相對(duì)較小,結(jié)果穩(wěn)定。從而意味著樣品的濃度不能過低,或者過高(超過光度計(jì)的測試范圍)。最后是操作因素,如混合要充分,否則吸光值太低,甚至出現(xiàn)負(fù)值;混合液不能存在氣泡,空白液無懸浮物,否則讀數(shù)漂移劇烈;必須使用相同的比色杯測試空白液和樣品,否則濃度差異太大;換算系數(shù)和樣品濃度單位選擇一致;不能采用窗口磨損的比色杯;樣品的體積必須達(dá)到比色杯要求的最小體積等多個(gè)操作事項(xiàng)。
儀器參數(shù)
UL-1000超微量紫外可見分光光度計(jì)產(chǎn)品參數(shù)
1.產(chǎn)品簡介
超微量紫外可見分光光度計(jì)是一類很重要的分析儀器 ,無論在物理學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、材料學(xué)、環(huán)境科學(xué)等科學(xué)研究領(lǐng)域 ,還是在化工、醫(yī)藥、環(huán)境檢測、冶金等現(xiàn)代生產(chǎn)與管理部門 ,超微量紫外可見分光光度計(jì)都有廣泛而重要的應(yīng)用。超微量紫外可見分光光度計(jì)就是利用分光光度法對(duì)物質(zhì)進(jìn)行定量定性分析的儀器,常用于核酸,蛋白定量以及細(xì)菌生長濃度的定量。超微量紫外可見分光光度計(jì)已成為現(xiàn)代分子生物實(shí)驗(yàn)室常規(guī)儀器。
2.儀器特點(diǎn)
*檢測所需樣微量,最低只需0.5ul
*檢測范圍寬,比傳統(tǒng)的分光光度計(jì)的上限高100倍
*對(duì)于多數(shù)樣品而言,無需稀釋
*機(jī)器無需預(yù)熱,直接測量,無需檢測容器,日常消耗低
*全波長190-1100nm,分辨率1nm,儀器都自動(dòng)給出全波長的掃描結(jié)果190-850nm
*體積小巧,便攜式包裝,滿足現(xiàn)場檢測的需求
*通過PC控制實(shí)現(xiàn)更精確和靈活的測量
3.技術(shù)指標(biāo)
*最小樣本量:0.5μl
*光程:1mm/0.2mm
*波長范圍:190~850nm
*波長精度:1 nm
*波長分辨率:≤0.3nm(FWHM 在 Hg 253.7nm)
*吸光率精度:2%(0.76 在 257nm)
*吸光率分辨精度:0.002Abs(1mm 光程)
*吸光率范圍:0.02~300 (等效10mm光程)
*可準(zhǔn)確測量范圍:0.1~5 Abs. ±0.1Abs 5~80 Abs. ±2%
*偵測器:3648像素線性CCD陣列
*光源:微型氙氣閃光燈系統(tǒng)
*測量時(shí)間:<5 秒
*尺寸:200mm×130mm×136mm(L×W×H)
*重量:≤ 2.0kg
*樣本檢測平臺(tái)材質(zhì):304 不銹鋼和石英
*輸入電壓:AC100~240V 50-60Hz
*操作電源功率:24W
關(guān)于我們
上海美析儀器公司簡介
上海美析儀器有限公司(以下簡稱美析),是一家具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的高新技術(shù)企業(yè),美析的創(chuàng)業(yè)理念“科技——因你改變”,并以此為企業(yè)宗旨,不斷探究、果敢創(chuàng)新。特別是在分析測試儀器領(lǐng)域,不斷開發(fā)出先進(jìn)的產(chǎn)品,使美析成為優(yōu)質(zhì)儀器資源的供應(yīng)者。
美析主營光譜類儀器可見分光光度計(jì)、紫外可見分光光度計(jì)、原子吸收光譜儀、超微量分光光度計(jì)、原子熒光光度計(jì)、ICP電感耦合等離子體發(fā)射光譜儀、ICP電感耦合等離子體質(zhì)譜儀,目前,我們的產(chǎn)品已廣泛應(yīng)用于有機(jī)化學(xué)、無機(jī)化學(xué)、生物化學(xué)、醫(yī)藥、環(huán)保、冶金、石油、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。同時(shí)美析利用在產(chǎn)品機(jī)械結(jié)構(gòu)、光學(xué)設(shè)計(jì)、電氣應(yīng)用和軟件開發(fā)方面積累的豐富經(jīng)驗(yàn),結(jié)合市場的最新實(shí)際需求,近期將陸續(xù)推出一批全新的分析類儀器。
美析的總部及生產(chǎn)基地設(shè)在上海,營銷中心設(shè)在北京,并在江蘇、上海、山東三地建有研發(fā)基地。為充分利用各地的智力資源,美析與國內(nèi)外的部分科研單位也進(jìn)行了深層次的科研合作,不斷將科研成果轉(zhuǎn)化為生產(chǎn)力。為更好的服務(wù)于廣大客戶,美析儀器國內(nèi)設(shè)有12家辦事機(jī)構(gòu),度身定制符合您需求的應(yīng)用解決方案,提高產(chǎn)品的附加值。在不斷服務(wù)國內(nèi)用戶同時(shí),20多個(gè)國家的分銷機(jī)構(gòu)建立了深度的戰(zhàn)略合作關(guān)系。
(美析儀器不僅僅只是一家高新技術(shù)認(rèn)證企業(yè),更通過了CE認(rèn)證、FCC認(rèn)證、RoHS認(rèn)證以及國內(nèi)多項(xiàng)資質(zhì)審查認(rèn)證,并有著多項(xiàng)自行研發(fā)的光譜類專利版權(quán)等等)